A e-Contab utiliza duas formas de pagamento: assinatura recorrente e o modelo Pague o Quanto Usa como forma de cobrança de serviços.

A recorrência consiste na cobrança mensal de valores fixos correspondentes a soluções contratadas e aceitas pelo contratante. Os produtos de assinatura estão sujeitos a contratos com duração de 12 meses. Os pagamentos recorrentes podem ocorrer por meio de boleto bancário ou cartão de crédito.

O modelo Pague o Quanto Usa consiste na venda do software por um valor fixo que pode ser dividido em até 12 vezes e não há mensalidade. Os serviços de suporte e atualizações são vendidos separadamente conforme a necessidade do cliente também por um valor fixo em planos individuais de pacotes de serviços.
Os pagamentos desse modelo podem ocorrer por meio de boleto bancário à vista ou cartão de crédito. Os dois modelos se aplicam aos seguintes sistemas: Administrador de Escritório, Busca XML, Contabilidade, Controle Patrimonial, Financeiro, Folha de Pagamento, Livros Fiscais, Nota Fiscal Eletrônica e Perfil Prof. Previdenciário.

Ambas as cobranças não se aplicam aos serviços de consultoria e implantação, os quais são cobrados e prestados uma única vez, mediante contratação.